В 1610-х годах собор обстроен двухъярусными папертями-галереями с крыльцами и северным приделом Николы. В 1864-1869 годах произведена реконструкция: разобраны паперти, сделаны боковые пристройки, с западной стороны пристроен новый собор. В советское время в здании размещался областной архив. В 1982 году произошёл пожар. В 1985-1991 годах проведена реставрация по проекту архитектора А.П. Чернова.