Деревянная церковь Рождества Богородицы на крутом правом берегу Южного Буга появилась в 1764 году на месте, где стоял замок Юрася Хмельницкого. Фундаменты для нее, а также ограждение, построили из камня из разобранного дворца молдавского воеводы —турецкого наместника.
Такой тип деревянных храмов в Центральной Украине иногда называют "казацкими". Церковь в Печере трехсрубная и трехъярусная. Повышенный первый ярус делает церковь высокой и невероятно стройной. Храм когда-то имел гонтовую крышу, которую позже заменили железной. В 1838 году к западному и южному фасадам достроили ампирные тамбуры с полуколоннами и фронтончиков.
В 1786 году рядом появился белый каменный крест, а в 1865 году к западу от церкви построили каменную колокольню. Еще недавно колокольня имела архаичный вид благодаря обнаженным камнями из разобранного дворца и отсутствия завершения. Несколько лет назад колокольню отштукатурили и достроили третий ярус с завершением.