проект реставрации: H. Uuetalu, 2004. Надзор за охраной наследия: Хейно Ууеталу
В 2004 году была завершена реставрация фасадов церкви (в части южного фасада и хорового зала), крыша двух часовен из оцинкованной стали заменена кровлей из медного листа, установлены водосточные трубы и водостоки. На эти цели из городского бюджета Таллинна было выделено 2,5 миллиона крон. В рамках проекта «Возрождение Таллиннской церкви» в 2002-2004 годах на восстановление церкви было израсходовано 6,5 миллиона крон.
Реставрационные работы на шпиле собора начались в первых месяцах 2022 года по проекту OÜ Rändmeister (Айн Пихл). Необходимость восстановления шпиля церкви была вызвана состоянием медного листа, установленного неподходящими методами в конце советской эпохи, неправильными деталями и периодическими расшатываниями несущей конструкции башни. Жестяная крышка башенного шлема уже не удерживала воду, поскольку местами была очень тонкой, из-за слишком больших плиток рвалась, да еще и одноразовые рулоны раскрылись. Уникальность металлообработки Домской церкви в 2022 году обусловлена, прежде всего, правильным монтажом рулонной черепицы: нет кривых, вмятин и других неровностей. Первоклассное мастерство жестянщиков было отмечено и на вручении ежегодной награды Совета по охране наследия 2022 года, где мастера шпиля и трое главных мастеров получили признание как номинант на лучшего реставратора.