Выстроен повелением Ивана III в 1505-1508 Алевизом Новым с использованием мотивов венецианской архитектуры. Великокняжеская и царская усыпальница. Приделы: Покрова Пресвятой Богородицы, Уара мученика, Третьего обретения Главы Иоанна Предтечи. В 1773 году во время строительства Большого Кремлёвского дворца в стенах собора появились трещины ввиду чего южная стена была укреплена контрфорсами. Закрыт в 1918; с 1955 — общедоступный музей. Богослужения редки.

В храме расположены 46 гробниц в которых расположены 52 захоронения, некоторые из них:
* великого князя Ярослава Владимировича (князь боровско-ярославецкий)
* великого князя Дмитрия Ивановича Донского
* великого князя Ивана I Даниловича Калиты
* великого князя Ивана III Васильевича
* царя Фёдора Ивановича
* царя Ивана IV Васильевича Грозного
* царевича Дмитрия сына Ивана IV (перевезено в 1606 году из Углича)
* царя Алексея Михайловича
* царя Михаила Фёдоровича и сына — царевича Василия Михайловича
* царя Василия Ивановича Шуйского
* царя Ивана Алексеевича
* царя Фёдора Алексеевича
* императора Петра II