Строительство церкви на Лахтинской улице, несмотря на протесты горожан, началось в декабре 2010 года. После сноса одноэтажного строения (дом 17) на месте предполагаемого храма и начала установки строительных свай, по соседнему дому пошли трещины, в результате чего стройку временно заморозили, а проект решили скорректировать. Строительство было возобновлено, и в марте 2015 года церковь была доведена до куполов. На начало сентября 2015 года на центральном куполе был установлен крест.

В марте 2017 года закончилась внешняя отделка храма и были сняты леса. Ведётся работа по внутренней отделке, написанию икон. Руководитель коллектива проектировщиков храма Геннадий Фомичёв отметил, что «когда здание было построено и завершена его внешняя отделка, авторы убедились, что ещё в самом начале пути, в первых эскизах они правильно выбрали пропорции постройки». 6 июня 2019 года храм был освящён митрополитом Санкт-Петербургским и Ладожским Варсонофием.

Предполагается, что храм построен на месте, где стоял дом, в котором жила блаженная Ксения Петербургская со своим мужем.