В центре комплексно используется несколько современных методик диагностики и лечения.
Диагностическое отделение располагает оборудованием МРТ, КТ, УЗИ. Флагман диагностики в центре, позитронно-эмиссионная томография, совмещенная с компьютерной томографией (ПЭТ/КТ). Важнейшей структурной составляющей диагностического процесса является наличие собственного циклотронно-радиохимического комплекса по производству радиофармпрепаратов для обеспечения работы блока радионуклидной диагностики.