Станция железнодорожного вокзала Таллинн-Садама находилась в районе между Нарвским шоссе и улицей Туукри (немного северо-восточнее нынешнего Таллиннского университета), над нынешним зданием на улице Туукри 58. Здание вокзала было снесено в 1979 году перед олимпийской регатой летних Олимпийских игр 1980 года. Здание вокзала было похоже на здание вокзала Таллинн-Вяйксе: оба представляли собой двухэтажные вокзальные здания из известняка с навесом и водонапорной башней.
Большая часть вокзального комплекса Таллинн-Садама, включая главное здание вокзала, была снесена, когда был расширен Педагогический университет и рядом на улицах Туукри и Нафта были построены новые здания. До 2020-х годов сохранился один склад — амбар станции Таллинн-Садама по улице Туукри.