Каменная небольшая Богоявленская церковь в Пекшево появилась в 1826 году на средства купчихи Александры Нечаевой. Церковь не имела собственного священника и являлась приписной к Богословской церкви в соседнем селе Глушицы. В храме имелась библиотека в 47 томов, церковные земли охватывали 33 десятины.
В настоящее время Церковь Богоявления Господня в с. Пекшево решением облисполкома № 219 от 17.04.1987 г. и постановлением администрации Воронежской области N 850 от 14.08.95 г. является объектом исторического и культурного наследия областного значения.