Для нужд рабочих дирекция на территории фабрики построила каменную покойницкую, которая была перестроена впоследствии в часовню, а затем и в церковь. Точное время строительства здания не известно. Здание такого же размера, как и церковь, впервые было показано на планах Балтийского хлопчатобумажного комбината в 1913 году, согласно которому здание датировано. В 1960-1970 годах зал церкви был расширен. В 1980 году для церкви были построены вспомогательные помещения. В 1985 году церковь была пересмотрена в связи с инвентаризацией истории архитектуры эстонских апостольских православных церквей. В 1997 году признание церковного здания памятником архитектуры было отчасти связано со стремлением сохранить целостность ансамбля крупного промышленного комплекса. Расширения, сделанные в 1950-1980 годах, не исказили важную историческую церковь. В 1998 году проект перестройки архитектора Н. Якобишвили изменил объемный дизайн главного зала церкви. В 1999 году ремонт, произведенный в 1998 году, был окончен. В 2006 году верхняя часть среднего отверстия алтарной стены была реконструирована в круговую дугу.