Дата основания неизвестна. Как Борисоглебская слобода впервые упоминается в 1393 году. Первое упоминание о Шуе относится к 1539 году. Входил в состав Суздальско-Нижегородского княжества. С 1727 года в составе Московской губернии, с 1781 — Владимирского наместничества (губерния с 1796), с 1918 — Иваново-Вознесенской губернии, с 1929 — Ивановской промышленной области, с 1936 — Ивановской области. С 1781 года административный центр уезда, с 1929 — районный центр. В 1929-1930 годах центр Шуйского округа Ивановской промышленной области. Население 58,5 тыс. человек (перепись 2010).